Le musée porte le nom d'Ernest Cognacq (1839-1928) et Marie-Louise Jay (1838-1925).
D'origine modeste, ils avaient ouvert, peu avant 1870, une boutique de nouveautés sur les quais, à Paris, qui allait devenir en quelques années l'un des grands magasins de la capitale, la Samaritaine.
D'esprit ouvert, Ernest Cognacq était un homme de son temps : le célèbre magasin du Pont Neuf est en effet l'œuvre des architectes Frantz Jourdain et Henri Sauvage, pionniers de la modernité au début du XXe siècle.
Sans enfant, le couple Cognacq-Jay s'est consacré à de nombreuses œuvres sociales (crèches, hôpitaux et hospices) et culturelles. Marie-Louise Jay fondait en 1906 un jardin botanique, la Jaysinia, à Samoens (Haute Savoie), tandis que son époux finançait la même année un musée d'histoire locale à Saint-Martin de Ré - leurs deux villes natales.
Une rue porte aussi leur nom, à Paris, devenue célèbre lorsque la Radio Télévision française s'y est installée.
C'est à partir de la toute fin du XIXe siècle qu'Ernest Cognacq, proche de la soixantaine et déjà riche, est devenu collectionneur.
Comme de nombreux amateurs de l'époque, il appréciait avant tout l'art du XVIIIe siècle, considéré alors comme l'expression la plus aboutie du raffinement, en particulier français.
À la mort de sa femme, en 1925, Ernest Cognacq, décide de léguer ses collections à la Ville de Paris.
Un an après sa propre disparition, en 1929, le musée Cognacq-Jay est inauguré.
Le musée Cognacq-Jay n'est pas accessible aux personnes à mobilité réduite.
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